Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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