Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCTD4Q8WVF5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCTD4Q8WVF5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms