Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1BQ8WUY9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.8 ms