Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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