Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms