Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD5Q8TDI0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD5Q8TDI0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD5Q8TDI0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD5Q8TDI0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD5Q8TDI0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms