Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BHLHE22Q8NFJ8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms