Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms