Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms