Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP4Q8N3C7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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