Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms