Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT1Q8IXI2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT1Q8IXI2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms