Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms