Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KSR1Q8IVT5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms