Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX29P2Q8IUI4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms