Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNL1Q8IU54 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms