Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DZIP3Q86Y13 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DZIP3Q86Y13 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DZIP3Q86Y13 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms