Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms