Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms