Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF1

TSPAN33, Tetraspanin-33, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN33Q86UF1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN33Q86UF1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN33Q86UF1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms