Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU1Q7Z7A3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms