Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms