Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT27Q7Z3Y8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms