Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP54Q7Z3B4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms