Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms