Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZD4Q76G19 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms