Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms