Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms