Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPTNQ6XPR3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPTNQ6XPR3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPTNQ6XPR3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPTNQ6XPR3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPTNQ6XPR3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms