Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms