Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms