Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms