Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms