Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFSP1Q6NVU6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms