Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2Q6NTF9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDD2Q6NTF9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms