Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL6IP4Q66PJ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL6IP4Q66PJ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms