Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOCADQ5VW36 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms