Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT2Q5VUG0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms