Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP9Q5VTM2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms