Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RSPH4AQ5TD94 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms