Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN11Q5T124 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN11Q5T124 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms