Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms