Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms