Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD3Q5JV73 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD3Q5JV73 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms