Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AMER1Q5JTC6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AMER1Q5JTC6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
AMER1Q5JTC6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms