Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM47AQ5JRC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM47AQ5JRC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms