Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRB2Q5IJ48 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRB2Q5IJ48 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms