Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF628Q5EBL2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF628Q5EBL2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF628Q5EBL2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF628Q5EBL2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms