Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZC3H12AQ5D1E8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms