Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms